En fonction des besoins exprimés par les autorités gouvernementales, le Commandement de la défense aérienne et des opérations aériennes (CDAOA) planifie et conduit toutes les missions aériennes menées à l'échelle nationale contre le COVID-19 :
- Évacuations aérosanitaires en A330 Phénix en configuration Morphée
- Transfert de patients en Caracal et Puma
- Transport de personnels soignants en renfort en Île-de-France
- Transfert de patients en Casa et en A400M
Le CDAOA intègre également les moyens aériens civils mis à la disposition du ministère des Armées (Falcon 8x et 900 de Dassault Aviation par exemple).